Microscopio invertido es un microscopio óptico con su fuente de luz y lente de condensador ubicada sobre la etapa de muestra, mientras que la lente objetivo se encuentra debajo de la etapa de muestra. Esta configuración es opuesta a los microscopios tradicionales (verticales). El diseño invertido hace que sea más fácil manejar muestras líquidas y muestras más gruesas, ya que la gravedad mantiene las muestras en su lugar sin resbalones de cubierta.